Eski Özel Harekât Dairesi Başkan Vekili İbrahim Şahin'in, Ergenekon'un 1 ve 2 numarasından bizzat emir aldığı ortaya çıktı. Soruşturma kapsamında son operasyonda gözaltına alınan Şahin, Susurluk çetesi lideri olmaktan 6 yıl hapis cezasına çarptırılmıştı.
Dava sürecinde geçirdiği bir kaza sebebiyle hafızasını yitirdiği gerekçesiyle Şahin'in cezası dönemin cumhurbaşkanı Ahmet Necdet Sezer tarafından affedilmişti. Aktifhaber'in haberine göre, İbrahim Şahin'in mahkeme kararıyla dinlemeye alınan telefon kayıtlarında ilginç konuşmalar yaptığı belirlendi. Şahin, bir telefon konuşmasında şu ifadeleri kullanıyor: "Tokat'ta kalmam gerekiyor. Tokat'ta beklemek için 1 ve 2 numaradan emir aldım. Öyle dediler." diyor. Şahin'e kimden emir aldığı soruluyor. Ancak, şüpheli isim vermiyor. Şahin'in 'Asena' diye hitap ettiği Fatma Cengiz ile arasında geçen görüşmelerde 'Yat Asena görev var. Ermeni öldürülmeli', 'Ermeni dövmen için sopa hazırlıyorum...' dediği belirlendi.